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尊龙凯时-人生就是博:单细胞空间技术提升结直肠癌研究分辨率

发布时间:2025-02-11   信息来源:尊龙凯时官方编辑

尊龙凯时-人生就是博此次研究的重点为结直肠癌(CRC)肿瘤微环境中免疫细胞群体的特征表征。研究使用了最新的10xVisiumHD平台,对来自CRC患者和正常邻近黏膜组织(NAT)的石蜡包埋样本进行分析,同时借助于Xenium和VisiumCytAssist(V2)技术进行结果验证。研究显示,10xVisiumHD技术在聚类分群和结肠组织形态特征的匹配上远超之前的VisiumV2版本,提供了高分辨率的数据支持。

尊龙凯时-人生就是博:单细胞空间技术提升结直肠癌研究分辨率

研究通过单细胞联合空间转录组分析,构建了一个详细的单细胞空间图谱,重点描述了肿瘤微环境中存在的不同免疫细胞类型,尤其是在肿瘤边缘区域。其中,研究发现两种促肿瘤的巨噬细胞亚群在肿瘤区域富集,这两种亚群显示出明显不同的基因表达谱和空间分布。进一步使用Xenium原位基因表达分析,研究团队还识别出了第三种巨噬细胞亚群,其基因表达特征与抗肿瘤反应相关。这些结果为CRC肿瘤微环境(TME)的细胞组成提供了全景视图,并揭示了不同免疫细胞群体的表型和空间分布差异。

在结果方面,研究首先利用10xVisiumHD与VisiumCytAssist技术对NAT(n=2)和CRC(n=1)样本进行检测。较高分辨率的VisiumHD技术在无监督聚类分析后识别出了更多的细胞聚类,并与组织形态学特征高度一致。此外,研究还进一步量化了典型标记物的丰度,为结果的空间准确性提供了保障。

在确立了VisiumHD数据的准确性后,研究利用解卷积方法结合单细胞数据分析,获取了细胞类型的空间分布信息,发现CRC肿瘤区域内癌相关成纤维细胞(CAF)和巨噬细胞的数量显著增加。这一发现为肿瘤微环境的研究提供了重要支持。

基于上述发现,研究对巨噬细胞标记显著表达的区域进行了无监督聚类分析,识别出在基因表达谱及空间定位上具有明显异质性的M2样亚群,分别标记为SPP1+和SELENOP+巨噬细胞。分析显示,这两类巨噬细胞通路富集与促肿瘤活性相关,暗示其在肿瘤发展中可能发挥了重要作用。

总的来说,研究中采用的VisiumHD技术在灵敏度和分辨率上实现了显著提升,其空间定位的准确性为细胞微环境的深入研究提供了有力支持。通过全面的单细胞空间图谱,本研究不仅明确了SPP1+和SELENOP+巨噬细胞在促肿瘤中的角色,也为未来的CRC研究开辟了新的视角。尊龙凯时-人生就是博,愿通过不断探索与创新,为生命科学的发展贡献力量。